Nella parte 4 parlo dei files nascosti.

Un file (che può anche essere un file di tipo directory) se inizia con un . (punto) allora non viene mostrato, tranne nei casi questo sia esplicitamente richiesto.

ls di default, senza specificare -a (All, tutto) non mostra tutti i file. Invece ls specificando -a elenca tutti i files (files del percorso specificato, e se non specificato files della directory corrente).